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淋巴结是HIV首先入侵的器官，感染之后会出现反应性、增生性肿大，这种淋巴結肿大一般是无痛性的。主要累及颈部、腋窝和枕部淋巴结，通常在感染第2周出现。急性感染期过后，淋巴结会逐渐缩小，也有少部分可能有持续的轻度淋巴结肿大，一部分患者还可能会出现轻度的肝脾肿大。

HIV急性感染期，咽痛也是最常见的表现之一。检查可以发现咽部充血和水肿，通常不伴有扁桃体肿大和扁桃体化脓，因为这可能是其他原因引起的。

有疼痛感的皮肤、黏膜溃疡，是急性HIV感染的独特症状之一，这种溃疡一般来说比较表浅，边界清楚，基底部是白色的，周围环绕一层薄的红色水肿区域，可出现于口腔黏膜、肛门、阴茎或食道。这种溃疡往往局限在一个部位，反复发作无法痊愈。如果是发生在食道部位的溃疡，患者可能会伴有吞咽疼痛。

虽然溃疡并不能直接诊断HIV感染，但由于HIV主要通过性传播，这些溃疡可能是一些单纯疱疹病毒感染或梅毒引起的。在这些病毒感染在这些疾病的基础上，可能更容易传播HIV，要引起重视。

艾滋病早期出现的皮疹，多为全身、广泛性的皮疹，通常出现在发热后48~72小时，持续5~8天。最常见的部位在上胸部、颈部、面部、头皮，手足等四肢部位也可能出现。

皮疹通常直径在5~10毫米，边界清楚，为椭圆形或圆形，呈粉色或深红色的斑疹或斑丘疹。个别患者会出现水疱疹、脓包性皮疹和荨麻疹样皮疹，但不太常见，一般不伴有瘙痒，或者仅有轻微的瘙痒。

由于胃肠道淋巴系统比较丰富，胃肠道也是HIV主要的靶器官。胃肠道症状主要的表现是恶心、腹泻、厌食等，及由此引发的体重减轻，平均减少5公斤体重。

艾滋病感染急性期，会常出现的头痛，表现为眼眶后疼痛，随着眼睛转动而加剧。其他严重的神经系统表现是无菌性脑膜炎，可以出现严重头痛、脑膜刺激征、畏光，脑脊液检查提示淋巴细胞增多。少部分患者在出现发热的同时，可以发现有明显的人格改变、意识模糊、肢体痉挛和无力等。不过，这些症状容易跟其他的神经系统疾病混淆。

有一部分患者可以出现呼吸系统的表现，比如干咳、呼吸国难，甚至有缺氧的感觉，但检查却并没有其他感染性疾病的证据。极少数的病人，还可能会出现病毒性心肌炎的表现。